O PPGCM concentra-se no desenvolvimento de linhas de pesquisa nas áreas clínica, epidemiológica, básica e translacional no campo da saúde humana, agrupadas nas seguintes subáreas: Clínica Médica; Saúde da Criança e do Adolescente; Gastroenterologia; Hematologia; Pneumologia; Neurologia; Nutrologia; Terapia Intensiva; Pesquisa Clínica; e Medicina Física.